Н. А. Волков
Целью курса является формирование знаний о современных компьютерных и информационных технологиях, используемых при моделировании и анализе физических, химических и биологических систем, а также навыков практического использования таких технологий. В рамках курса студенты учатся формулировать, в виде удобном для компьютерных расчетов, задачи статистической физики, т. е. строить соответствующие математические модели и выполнять их симуляцию на компьютере. Для изложения необходимой теоретической базы используется традиционная форма преподавания в виде лекций, при этом практические задания проводятся на компьютерах и включают в себя как разработку собственного компьютерного кода, так и использование кроссплатформенных свободно-распространяемых программных пакетов и технологий, таких как Packmol, Visual Molecular Dynamics, GROMACS, MDynaMix, Gnuplot, Inkscape, LaTeX, bash. Проводится сравнительный анализ существующих операционных систем и даются теоретические и практические навыки установки, администрирования и использования операционной системы Linux (включая активную работу с командной строкой) для проведения компьютерного моделирования различных молекулярных систем, анализа и представления результатов моделирования.